Χαράλαμπε, υπάρχουν σημαντικές διαφορές ανάμεσα στα δύο τμήματα. Το περιεχόμενο του εφαρμοσμένης πληροφορικής αναφέρεται στις εφαρμογές πληροφορικής στις διοικητικές και οικονομικές επιστήμες. Αυτό σημαίνει πρακτικά, οτι υπάρχουν κάποια μαθήματα όπως Μικροοικονομία, Μακροοικονομία, Διοίκηση Επιχειρήσεων κλπ. Η απουσία τέτοιων μαθημάτων στο τμήμα Πληροφορικής (του ΑΠΘ) σημαίνει πως υπάρχουν περισσότερα και πιθανά και σε πιο εξειδικευμένα γνωστικά αντικείμενα, μαθήματα πληροφορικής.
Επαγγελματικά τυπικά δεν έχει κάποια σχολή περισσότερα πλεονεκτήματα, αλλά πιστεύω πως ο μεν του Μακεδονίας έχει ένα πλεονέκτημα να εργαστεί ως στέλεχος μηχανοργάνωσης σε μια τράπεζα ή σε μια επιχείρηση οποιοδήποτε κλάδου έχει ξεχωριστό τμήμα μηχανοργάνωσης, ενώ ένας απόφοιτος του ΑΠΘ έχει πλεονέκτημα να εργαστεί σε μια εταιρεία που αναπτύσσει δραστηριότητες πιο εξειδικευμένες (πχ ανάπτυξη λογισμικού συστήματος). Όχι όμως οτι αποκλείεται στην πραγματικότητα για κάποιον απόφοιτο να συμβεί το αντίθετο.
