Μιλάω για windows
Από όσο ξέρω το this.hide εκτελεί μια εφαρμογή ως διεργασία 
Δεν ξέρω τι εννοείς διεργασία, όλα είναι διεργασίες. Το this.hide θα σταματάει το window που τρέχεις από το να κάνει render.
Για να απαντήσω σε αυτό που ρώτησες αρχικά.
Θες να τρέχει το πρόγραμμά σου ως service; Αν ναι, θα πρέπει να το γράψεις με τέτοιο τρόπο (που μπορώ να σου εξηγήσω, αλλά θέλει πιο μακροσκελή απάντηση). Εαν πάλι θες απλά να σηκώνεις ένα console application αλλά να μην σου δείχνει παράθυρο κονσόλας υπάρχουν δύο πράγματα που μπορείς να κάνεις. Το ένα είναι στην main να καλέσεις το FreeConsole() API των windows, οπότε να δεις για λίγο το παράθυρο και μετά να κλείσει. Εαν δεν θες για κανέναν λόγο παράθυρο, αυτό που μπορείς να κάνεις είναι φτιάξεις κανονικά ένα Win32 Console Application project και μετά να πας στις ρυθμίσεις του linker και να αλλάξεις το subsystem σε WINDOWS (Project->Properties->Configuration Properties->Linker->System και αλλάζεις την επιλογή SubSystem στο παράθυρο). Για να σου τρέξει απλώς αλλάζεις την main σου, στη main για εφαρμογές με παράθυρα.
Δηλαδή το αρχείο με τη main σου τώρα πρέπει να είναι έτσι:
#include "stdafx.h"
#include <windows.h>
int WINAPI _tWinMain(
HINSTANCE hInstance,
HINSTANCE hPrevInstance,
PWSTR pCmdLine,
int nCmdShow
)
{
UNREFERENCED_PARAMETER(hInstance);
UNREFERENCED_PARAMETER(hPrevInstance);
UNREFERENCED_PARAMETER(pCmdLine);
UNREFERENCED_PARAMETER(nCmdShow);
// Edw bazeis ton kwdika sou
return 0;
}
ΥΓ. Όταν μιλάω για project και ρυθμίσεις αναφέρομαι στο Visual Studio.